Řídicím orgánem Operačního programu Spravedlivá transformace je Ministerstvo životního prostředí. Zprostředkujícím subjektem je Státní fond životního prostředí. Dohled nad programem vykonává monitorovací výbor.
Monitorovací výbor průběžně posuzuje:
Zároveň monitorovací výbor schvaluje některé důležité dokumenty:
Monitorovací výbor se skládá ze zástupců řídicího orgánu, zprostředkujícího subjektu a zástupců partnerů (ministerstva, krajů, obcí, nestátních neziskových organizací, profesních organizací apod.). Každý člen monitorovacího výboru má hlasovací právo. Evropská komise se účastní činnosti monitorovacího výboru jako poradce.
Zápisy a prezentace ze zasedání Monitorovacího výboruV případě dotazů k monitorovacímu výboru lze využít e-mail: mv.opst@mzp.cz.