Hlavním účelem pracovních skupin je nastavení základních mechanismů v jednotlivých podporovaných oblastech programu.
Na prvotních setkáních pracovních skupin byly nejprve diskutovány detaily vymezení podporovaných opatření mezi Operačním programem Spravedlivá transformace (OPST) a ostatními dotačními programy. Po spuštění programu jsou hlavními činnostmi pracovních skupin především projednávání obsahu plánovaných výzev, harmonogramu výzev a příprava odborných stanovisek a expertíz k jednotlivým tématům pracovních skupin.
Členy pracovních skupin jsou zástupci z Ministerstva životního prostředí, Státního fondu životního prostředí ČR, Ministerstva pro místní rozvoj a dalších rezortů podle zaměření dané pracovní skupiny. Pracovních skupin se dále účastní zástupci ze všech tří dotčených regionů, zástupci neziskového sektoru, externí odborníci a další.
Výčet pracovních skupin při OPST je následující:
- PS Podnikání
- PS Výzkum a inovace
- PS Digitalizace
- PS Čistá energie
- PS Oběhové hospodářství
- PS Obnova území
- PS Trh práce
- PS Školství
- PS Strategické projekty
